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Binding

基于片段的藥物發現的化學位移擾動分析

Mnova Binding可以用于基于片段的藥物發現的化學位移擾動分析,是一個強大的工具,可以自動處理2D HSQC實驗的蛋白質配體滴定譜圖,跟蹤峰值移動并計算多個峰值的Kd。

對多個峰的Kd進行統計分析,還可以將測量的CSP提交給第三方軟件(AFFINImeter),以便使用不同的結合模型對結合等溫線進行高級分析。

 

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對1D和2D NMR滴定進行化學位移擾動 (CSP) 分析

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亮點

Mnova使RM數據的分析變得簡單,為分析可能有些棘手的數據提供了一套先進的軟件解決方案。

直觀的工作流程,可讓您以交互方式或全自動方式分析CSP滴定譜圖。

自動對峰值移動進行跟蹤、測量化學位移擾動 (CSP),將其與配體濃度相匹配以計算Kd。

校正擁擠譜圖區域中的自動峰值移動跟蹤。

提供用于處理和堆疊多個2D HSQC譜圖的工具,以不同的顏色顯示它們。

輕松導出CSP值,以進一步研究配體-蛋白質結合模型。

Mnova Binding包含用于NMR的AFFINImeter的免費1年的使用權

用于核磁共振的AFFINImeter允許對來自2D NMR滴定的結合等溫線進行高級分析,以測量結合常數 (KA)。結合等溫線直接從軟件Mnova導入,AFFINImeter-NMR中提供了一系列高級工具,以充分利用NMR數據,包括:

結合等溫線的全局分析

使用復雜的Binding模型進行分析

先進的算法保證收斂避免局部最小值,以及評估參數的不確定性、擬合優度和結果可靠性

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特征

譜峰跟蹤:

自動跟蹤和測量具有CSP的HSQC疊加譜圖。左圖顯示了兩個歸屬譜峰的移動。右側顯示了其中一個跟蹤峰“13C-H”的詳細信息,包括配體/蛋白質的濃度比、任意維度的CSP測量值、歸一化CSP以及Kd的擬合結果和誤差。。

測量&擬合:

化學位移擾動的常規選項卡顯示了滴定光譜、蛋白質濃度、配體濃度以及配體與蛋白質濃度比的配色方案列表。

它還顯示了所有分析峰的CSP測量和Kd擬合列表,以及Kd的平均值和標準誤差。

全自動分析:

只需在“titration file”中按順序列出滴定系列即可。所用配體的名稱編碼在“ligands file”中。當CSP自動運行分析時,它會為“titration file”中列出的每個滴定創建不同的Mnova文件,并且Mnova文件根據配體的名稱進行命名。。

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市場(學術、政府&工業)

  •      ✯ 在基于片段的藥物發現、SAR-by-NMR 和配體-蛋白質結合           篩選領域工作的NMR專家和藥物化學家
  •      ✯ 使用滴定核磁共振方法進行一般蛋白質-蛋白質、蛋白質-配           體相互作用研究的研究人員

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